Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM47EQ6ZV65 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM47EQ6ZV65 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms