Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FBXW12Q6X9E4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms