Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3CQ5T2N8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms