Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPP1R3AQ16821 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP1R3AQ16821 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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