Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms