Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP1Q15431 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SYCP1Q15431 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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