Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNB1Q14721 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms