Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RNF123-207ENST00000457726 4506 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.532e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RNF123-213ENST00000498376 746 ntTSL 311.22□□□□□ -0.612e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 ATG4D-210ENST00000588972 632 ntTSL 59.81□□□□□ -0.841e-15■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 EMC3-201ENST00000245046 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AGAP3-203ENST00000461065 1707 ntTSL 1 (best)17.75■□□□□ 0.438e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AGAP3-212ENST00000473633 3751 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.758e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-10■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.271e-10■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.21e-10■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-10■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-10■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.251e-10■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AGPAT1-208ENST00000490711 2448 ntTSL 210.96□□□□□ -0.661e-10■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 COPE-205ENST00000595984 434 ntTSL 314.52□□□□□ -0.095e-10■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 BST2-203ENST00000533098 459 ntTSL 211.58□□□□□ -0.561e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RPS8-204ENST00000470475 981 ntTSL 218.02■□□□□ 0.483e-75■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.057e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.847e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.697e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 ABHD14B-207ENST00000487005 1998 ntTSL 219.2■□□□□ 0.667e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.527e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.347e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PCBP4-213ENST00000489595 539 ntTSL 414.28□□□□□ -0.127e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 521.96■■□□□ 1.115e-47■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 JAGN1-202ENST00000489724 342 ntTSL 321.8■■□□□ 1.089e-32■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 520.41■□□□□ 0.865e-47■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.092e-16■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.372e-16■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.772e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.93e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 NIPBL-208ENST00000514335 2948 ntTSL 28.14□□□□□ -1.113e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 MYBBP1A-205ENST00000571368 1995 ntTSL 220.43■□□□□ 0.867e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 MYBBP1A-212ENST00000574934 1941 ntTSL 216.07■□□□□ 0.167e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.127e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 MYBBP1A-209ENST00000573723 613 ntTSL 514.81□□□□□ -0.047e-7■■■□□ 17.4
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PABPC4Q13310 MYBBP1A-207ENST00000573116 3795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.38□□□□□ -0.597e-7■■■□□ 17.4
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PABPC4Q13310 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.542e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FAAP20-201ENST00000378543 569 ntTSL 228.43■■■□□ 2.142e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FAAP20-206ENST00000414253 2216 ntTSL 226.76■■□□□ 1.872e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FAAP20-203ENST00000400918 811 ntTSL 226.76■■□□□ 1.872e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FAAP20-209ENST00000428120 2313 ntTSL 1 (best)25.85■■□□□ 1.732e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FAAP20-205ENST00000401813 2543 ntTSL 1 (best)20.73■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FAAP20-211ENST00000469733 2280 ntTSL 219.04■□□□□ 0.642e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FAAP20-213ENST00000487186 3576 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 CDK12-208ENST00000584336 1963 nt11.65□□□□□ -0.542e-7■■■□□ 17.4
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PABPC4Q13310 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 ABCB8-213ENST00000482309 1994 ntTSL 221.15■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 17.4
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PABPC4Q13310 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 58.24□□□□□ -1.098e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 ATG9A-215ENST00000446716 5245 ntTSL 220.03■□□□□ 0.88e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.366e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.452e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)21.55■■□□□ 1.042e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 420.04■□□□□ 0.82e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 PRKRA-202ENST00000424699 1616 ntTSL 225.29■■□□□ 1.643e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.333e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 METTL2A-201ENST00000311506 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.513e-11■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 METTL2A-202ENST00000333483 1556 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.63e-11■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.993e-11■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 WBP11-203ENST00000535638 787 ntTSL 58.62□□□□□ -1.033e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 PRKRA-212ENST00000490501 1851 ntTSL 27.43□□□□□ -1.223e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.148e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.048e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FOXM1-206ENST00000536066 2518 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.858e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.888e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.238e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 C19orf60-203ENST00000595077 2465 nt15.18■□□□□ 0.024e-10■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.195e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.845e-7■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 PARL-203ENST00000417784 722 ntTSL 312.46□□□□□ -0.413e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 PARL-204ENST00000418450 546 ntTSL 311.44□□□□□ -0.583e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 PARL-208ENST00000450375 488 ntTSL 210.97□□□□□ -0.653e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 STRBP-205ENST00000471564 535 ntTSL 59.26□□□□□ -0.934e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 STRBP-206ENST00000478973 663 ntTSL 59.09□□□□□ -0.954e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 ZNHIT1-202ENST00000461205 571 ntTSL 311.07□□□□□ -0.648e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 GSTM4-212ENST00000495742 1159 ntTSL 1 (best)26.46■■□□□ 1.839e-10■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.349e-10■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.159e-10■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 GSTM4-202ENST00000336075 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.129e-10■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 GSTM4-213ENST00000638994 657 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.129e-10■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 GSTM4-211ENST00000493395 913 ntTSL 313.18□□□□□ -0.39e-10■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.929e-10■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 KCMF1-204ENST00000456682 661 ntTSL 331.16■■■□□ 2.585e-9■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.855e-9■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.795e-9■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.815e-9■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 LDAH-204ENST00000403006 1895 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.149e-8■■■□□ 17.4
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