Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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