Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms