Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA2D1P54289 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA2D1P54289 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms