Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOX11P35716 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOX11P35716 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms