Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPHA1P21709 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms