Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF888P0CJ79 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms