Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms