Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHOC2Q9UQ13 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms