Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COPG2Q9UBF2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms