Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms