Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC22A11Q9NSA0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms