Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPANXA1Q9NS26 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPANXA1Q9NS26 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPANXA1Q9NS26 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms