Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIRIP3Q9BW71 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms