Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VAMP8Q9BV40 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms