Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPIN2AQ99865 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms