Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP4Q96PP9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms