Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDC3Q96F86 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms