Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC8EQ6NSJ5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms