Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC96Q2M329 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms