Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMCO1Q147U7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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