Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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