Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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