Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELP6Q0PNE2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms