Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms