Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC18A2Q05940 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms