Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK5Q00535 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms