Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HBBP68871 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HBBP68871 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HBBP68871 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HBBP68871 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HBBP68871 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HBBP68871 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HBBP68871 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms