Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBA52P62987 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA52P62987 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms