Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABCE1P61221 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCE1P61221 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms