Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB5BP61020 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5BP61020 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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