Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms