Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms