Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms