Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBR1P36897 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms