Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RYKP34925 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RYKP34925 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RYKP34925 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RYKP34925 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RYKP34925 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RYKP34925 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RYKP34925 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RYKP34925 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RYKP34925 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYKP34925 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYKP34925 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms