Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH1P12830 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH1P12830 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH1P12830 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH1P12830 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms