Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms