Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms