Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms