Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms