Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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LINC00587B1AMM8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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