Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms